Do tela sa dostávajú už pri našom narodení (kolonizujú črevo) a ich množstvo aj druh závisí od viacerých faktorov: výživa, vek, cvičenie, genetika, stres, stav imunitného systému, užívanie liekov. Dôležité je si uvedomiť, že tieto baktérie v našom tele nepretrvávajú od narodenia až po smrť a telo ich samé ani nevie produkovať, preto ich je potrebné pravidelne dopĺňať z výživy. Užívanie niektorých liekov, najmä antibiotík, vedie k významnej zmene zloženia črevnej flóry. Preto je spolu s antibiotickou liečbou potrebné súčasne užívať aj probiotiká ako prevenciu hnačiek a brušného diskomfortu spôsobených porušením normálneho zloženia bakteriálnej črevnej flóry pri liečbe antibiotikami. Užívať súčasne s antibiotickou liečbou probiotické prípravky je dnes už takmer automatické, resp. malo by byť.