Flukonazol je indikovaný na liečbu a profylaxiu mykotických infekcií:
1. Systémová kandidóza, diseminovaná kandidóza vrátane kandidémie a ďalšie formy invazívnej kandidovej infekcie, medzi ktoré patria infekcie pľúc, pečene a sleziny, peritonea, postihnutie endokardu, oka, močového traktu, meningov a ďalších orgánov. Liečba je indikovaná najmä u pacientov s malígnym ochorením, ktorí dostávajú cytotoxickú alebo imunosupresívnu terapiu, alebo sú vplyvom iných faktorov predisponovaní na kandidovú infekciu.
2. Slizničné kandidózy, ku ktorým patrí orofaryngeálna, pažeráková a neinvazívna bronchopulmonálna infekcia, kandidúria, mukokutánna a chronická orálna atrofická kandidóza (zápaly, ktoré vznikli pod umelým chrupom). Liečiť je možné chorých imunologicky oslabených, ako aj osoby s neporušenou imunitou.
3. Kryptokokóza (kryptokoková meningitída a iné formy infekcie - napr. pľúcna, kožná). Na liečbu chorých bez imunitného deficitu i pacientov s AIDS, po orgánovej transplantácii či s inou formou porušenej imunity. Flukonazol sa môže použiť na udržiavaciu liečbu na zabránenie relapsu kryptokokového ochorenia u pacientov s AIDS.
4. Systémové endemické mykózy u imunokompetentných (kokcidiomykóza, parakokcidiomykóza, sporotrichóza, histoplazmóza).
5. Profylaktické podanie. Prevencia relapsu orofaryngeálnej kandidózy u pacientov s AIDS. Primárna i sekundárna prevencia mykóz u pacientov s malignitami, u ktorých je zvýšené riziko týchto infekcií následkom cytotoxickej chemoterapie alebo rádioterapie.
Liek je určený deťom, mladistvým a dospelým.